細菌基因組完成圖真菌基因組完成圖微生物群落多樣性宏基因組測序服務全長轉錄組測序第三代測序服務非靶向代謝組學靶向代謝組學脂質組學離子組學脂肪酸檢測氨基酸檢測代謝組學服務定量蛋白質組服務雙向電泳服務修飾蛋白質組蛋白質芯片蛋白質譜鑒定蛋白互作檢測Western Blot蛋白質組學服務高通量測序數據分析蛋白質組學數據分析代謝組學數據分析芯片數據分析GO/Pathway富集分析相關性和聚類分析共表達網絡圖靶基因預測調控網絡圖蛋白相互作用網絡圖生物信息學服務CRISPR/Cas9載體構建穩定細胞系構建服務模式生物制備服務CRISPR/Cas9技術服務甲基化測序服務甲基化芯片服務甲基化驗證服務DNA甲基化服務lncRNA測序服務lncRNA芯片服務lncRNA定量PCR驗證lncRNA過表達服務lncRNA抑制服務lncRNA技術服務miRNA測序服務miRNA芯片服務miRNA定量PCR驗證miRNA過表達服務miRNA抑制服務miRNA靶基因驗證服務miRNA技術服務環狀RNA測序服務環狀RNA芯片服務環狀RNA定量PCR驗證環狀RNA過表達服務環狀RNA抑制服務環狀RNA技術服務轉錄組測序服務表達譜測序服務mRNA/lncRNA/環狀RNA 三合一芯片表達譜芯片服務熒光定量PCR驗證mRNA過表達服務mRNA抑制服務mRNA技術服務轉錄因子篩選服務抗體制備服務ChiP-Seq測序服務ChiP-qPCR技術服務EMSA技術服務luciferase 實驗服務轉錄因子技術服務mRNA定量PCR檢測miRNA定量PCR檢測lncRNA定量PCR檢測環狀RNA定量PCR檢測DNA拷貝數檢測相對定量PCR服務絕對定量PCR服務熒光定量PCR服務整體課題服務SNP分型檢測服務SSR/STR技術服務病毒包裝服務CRISPR/Cas9技術試劑miRNA功能研究試劑lncRNA功能研究試劑環狀RNA功能研究試劑mRNA功能研究試劑發表文獻樣品準備服務流程基金申請
表達譜芯片服務
服務詳情

簡介

表達譜芯片技術成熟,數據分析簡單可靠,出結果時間短,芯片結果與熒光定量PCR驗證吻合度高,價格便宜,性價比高,大批量樣品進行表達譜檢測時可以選擇芯片技術。

芯片結果

包括聚類分析、SAM統計分析、SOM分析、Pathway顯著性分析、GO功能顯著性分析、基因調控網絡圖等。


芯片結果展示

1、芯片掃描圖

  

 

2、差異基因聚類圖

聚類圖

樣品要求

1、總RNA:濃度≥200 ng/μl,總量≥10 μg;

2、組織樣品:動物、植物、微生物總量大于300 mg的新鮮樣品。

3、血液2ml以上,血清1ml以上。

4、保存在超低溫冰箱中,利用干冰運輸。

芯片種類

一、人類全基因組表達譜芯片服務

1、Affymetrix GeneChip Human Transcriptome Array 2.0 ——最新款同時檢測4萬多個編碼基因和4萬多個非編碼基因

最高分辨率的基因芯片,支持所有轉錄本異構體的全轉錄組分析,包含超過六百萬條不同探針,覆蓋編碼和非編碼轉錄本。

該芯片為每個外顯子設計約10條探針,每個外顯子之間的剪接點有4條探針,確保每個實驗都能獲得完整、準確和可重復的數據。重復性高(批內相關系數≥0.99),所有檢測過的組織觀察到的變異系數(CV)<6.5%。樣品類型既包括新鮮凍存樣品,也包括FFPE 樣本。

2、Affymetrix GeneChip Human Genome U133 Plus 2.0 Array——最經典芯片,已發表最多頂級文獻                

此款芯片包含了47,000個轉錄本,代表了38,500個明晰的人類基因。數據庫來源于GeneBank、dbEST、RefSeq、 UniGene database(Build 159 January 25 2003)、 Washington University EST trace repository、 NCBI human genome assembly(Build 31)。

3、Affymetrix GeneChip PrimeViewTM Human Gene Expression Array——最新款經濟型芯片

新版人3’ IVT表達譜卡式芯片,利用GeneChip? Scanner

3000 7G system平臺,據2011年6月份的數據庫設計,覆蓋人類基因組中確認的注解明晰的20000多個基因的36000多個轉錄本,具有超強靈敏度和高度的可重復性,低CV值,完全覆蓋帶注解基因組。

4、Affymetrix GeneChip Human Gene 2.0ST Array——新款芯片

Affymetrix新一代全轉錄本芯片,在一張芯片上可以同時檢測mRNA和lincRNA,在其上一代1.0 ST Array的基礎上,該芯片內容進一步豐富并更新數據庫。2.0 ST Array有更多的優點:全面覆蓋轉錄組,可以同時檢測>30,000個編碼的轉錄本和>11,000個長鏈非編碼轉錄本;探針設計最大程度覆蓋所有外顯子,可檢測選擇性拼接/轉錄本變體。每個轉錄本覆蓋特異探針的數目中值達到21種,每種探針的長度為25bp,這意味著每個轉錄本將被檢測的堿基數中值高達525個;重復性高;靈敏度高。

5、Agilent SurePrint G3 Human Gene Expression 8x60K ——最新款芯片,同時檢測編碼基因和非編碼基因

安捷倫人類表達譜芯片,基于G3平臺。除了涵蓋27,958條Entrez Gene RNAs外,更涵蓋7,419條lincRNA。不僅能檢測蛋白編碼RNA表達量的變化,也能檢測非編碼RNA的表達量變化。探針設計參照的數據庫為:RefSeq Build 36.3;Ensemble Release 52;Unigene Build 216;GenBank (April 2009)。非編碼RNA探針是和John Rinn 實驗室(隸屬于麻省理工學院-哈佛大學博德研究所)共同設計的。

6、Agilent Whole Human Genome Oligo Microarray 4×44K ——經典芯片,已發表很多頂級文獻

Agilent 的人全基因組表達譜芯片匯總目前所了解的人類全基因組序列信息,代表了超過41,000人類基因和轉錄本。設計該產品所用的序列信息源于對 RefSeq、Goldenpath、Ensembl和Unigene 等知名數據庫的深入研究,并與人類基因組拼接進行比對。絕大多數探針經過 Agilent專利的實驗驗證程序的檢驗和優化。

二、小鼠全基因組表達譜芯片服務

1、Affymetrix GeneChipMouse Transcriptome Assay 1.0——最新款,同時檢測2萬多個編碼基因和5萬多個非編碼基因

最高分辨率的小鼠基因芯片,支持所有轉錄本異構體的全轉錄組分析,覆蓋超過23,000個編碼基因(其中包括超過114,000個轉錄本; 332,000個外顯子以及215,000個外顯子簇)和超過55,000個非編碼基因(其中包括101,000個轉錄本; 222,000個外顯子以及162,000個外顯子簇)。該芯片為每個外顯子設計約10條探針,每個外顯子之間的剪接點有4條探針,確保每個實驗都能獲得完整、準確和可重復的數據。重復性高,批內相關系數≥0.99。樣品類型既包括新鮮凍存樣品,也包括FFPE 樣本。這種芯片的應用將加快人類疾病的臨床前研究,提高了從小鼠模型研究轉化到人類疾病研究的成功率。

2、Affymetrix GeneChip Mouse Genome 430 2.0 Array——最經典芯片,發表最多頂級文獻

Affymetrix 小鼠基因組430 2.0芯片涵蓋了39,000個轉錄本,代表34,000個明晰的小鼠基因。序列信息基于GeneBank、dbEST、RefSeq、UniGene database。

3、Affymetrix GeneChip Mouse Gene 2.0 ST Array——新款芯片

小鼠全轉錄本芯片,在一張芯片上可以同時檢測mRNA和lincRNA,可同時檢測>35,000個編碼的和非編碼的轉錄本及>2,000個長鏈基因間非編碼轉錄本

4、Agilent SurePrint G3 Mouse Gene Expression 8x60K ——新款芯片,同時檢測編碼基因和非編碼基因

安捷倫最新設計的小鼠表達譜芯片,基于G3平臺。除了涵蓋39,430條Entrez Gene RNAs外,更涵蓋16,251條lincRNA。不僅能檢測蛋白編碼RNA表達量的變化,也能檢測非編碼RNA的表達量變化。探針設計參照的數據庫為:RefSeq Build 37;Ensembl Release 55;Unigene Build 176;GenBank (April 2009);RIKEN 3。

5、Agilent Whole Mouse Genome Oligo Microarray, 4×44K——經典芯片,已發表很多頂級文獻

Agilent 小鼠全基因組表達譜芯片真正代表小鼠基因組中所有已知基因及其產生的轉錄本,代表了超過 41,174 個小鼠基因和轉錄本。設計該產品所用的序列信息源于對 UCSC、NIA、RefSeq、Ensembl、Unigene和RIKEN等知名數據庫的深入研究,而且絕大多數探針經過Agilent專利的實驗驗證程序的檢驗和優化。

三、大鼠全基因組表達譜芯片服務

1、Affymetrix GeneChip? Rat Transcriptome Assay 1.0 (RTA 1.0)——最新款,可同時檢測25000個編碼基因和61000個非編碼基因

芯片介紹:RTA1.0芯片中,每個外顯子約有10條探針,每個外顯子-外顯子剪接位點有4條探針。該分析可產生最全面、準確和可再現的全轉錄組表達數據。

2、Affymetrix GeneChip Rat Genome 230 2.0 Array——最經典,已發表最多頂級文獻

Affymetrix 大鼠基因組230 2.0芯片包含有31,000個probe sets,代表28,000個明晰的大鼠基因。序列信息基于GenBank , dbEST, RefSeq等權威數據庫。

3、Affymetrix GeneChip Rat Gene 2.0 ST Array——新款芯片

大鼠全轉錄本芯片,在一張芯片上可以同時檢測mRNA和lincRNA,可同時檢測>27,000個蛋白編碼轉錄本及>23,500個 Entrez基因

4、Agilent SurePrint G3 Rat Gene Expression 8x60K Kit——新款芯片

安捷倫最新設計的大鼠表達譜芯片,基于G3平臺。涵蓋30,003條Entrez Gene RNAs。探針設計參照的數據庫為:RefSeq Build 36.2;Ensembl Release 55;Unigene Build 177;GenBank (January 2009)。

5、Agilent Whole Rat Genome Oligo Microarray, 4×44K——經典芯片

Agilent 大鼠全基因組表達譜芯片真正代表大鼠基因組中所有已知基因及其產生的轉錄本,代表了超過 41,012 個大鼠基因和轉錄本。設計該產品所用的序列信息源于對 RefSeq、Ensembl、Unigene 和GenBank等知名數據庫的深入研究,而且絕大多數探針經過Agilent專利的實驗驗證程序的檢驗和優化。

四、其他物種表達譜芯片服務

Affymetrix 3' IVT Expression Array: 擬南芥、苜蓿、稻、大豆、大麥、小麥、柑橘、棉花、玉米、白楊、甘蔗、西紅柿、葡萄、酵母、果蠅、秀麗隱桿線蟲、牛、犬、雞、豬、恒河猴、非洲爪蟾、熱帶爪蟾、斑馬魚。

Affymetrix Gene 1.0 ST Array : 擬南芥、苜蓿、稻、大豆、果蠅、秀麗隱桿線蟲、牛、犬、雞、豬、恒河獼猴、食蟹獼猴、馬、貓、豚鼠、狨猴、羊、兔、恒河猴、斑胸草雀、斑馬魚、番茄。

Agilent 3' IVT Expression Array:擬南芥、苜蓿、稻、大麥、棉花、蕓苔屬植物、煙草、西紅柿、小麥、酵母、大腸桿菌、稻瘟菌、果蠅、秀麗隱桿線蟲、蚊子、牛、犬、雞、豬、馬、恒河猴、兔、三文魚、羊、非洲爪蟾、斑馬魚。