細菌基因組完成圖真菌基因組完成圖微生物群落多樣性宏基因組測序服務全長轉錄組測序第三代測序服務非靶向代謝組學靶向代謝組學脂質組學離子組學脂肪酸檢測氨基酸檢測代謝組學服務定量蛋白質組服務雙向電泳服務修飾蛋白質組蛋白質芯片蛋白質譜鑒定蛋白互作檢測Western Blot蛋白質組學服務高通量測序數據分析蛋白質組學數據分析代謝組學數據分析芯片數據分析GO/Pathway富集分析相關性和聚類分析共表達網絡圖靶基因預測調控網絡圖蛋白相互作用網絡圖生物信息學服務CRISPR/Cas9載體構建穩定細胞系構建服務模式生物制備服務CRISPR/Cas9技術服務甲基化測序服務甲基化芯片服務甲基化驗證服務DNA甲基化服務lncRNA測序服務lncRNA芯片服務lncRNA定量PCR驗證lncRNA過表達服務lncRNA抑制服務lncRNA技術服務miRNA測序服務miRNA芯片服務miRNA定量PCR驗證miRNA過表達服務miRNA抑制服務miRNA靶基因驗證服務miRNA技術服務環狀RNA測序服務環狀RNA芯片服務環狀RNA定量PCR驗證環狀RNA過表達服務環狀RNA抑制服務環狀RNA技術服務轉錄組測序服務表達譜測序服務mRNA/lncRNA/環狀RNA 三合一芯片表達譜芯片服務熒光定量PCR驗證mRNA過表達服務mRNA抑制服務mRNA技術服務轉錄因子篩選服務抗體制備服務ChiP-Seq測序服務ChiP-qPCR技術服務EMSA技術服務luciferase 實驗服務轉錄因子技術服務mRNA定量PCR檢測miRNA定量PCR檢測lncRNA定量PCR檢測環狀RNA定量PCR檢測DNA拷貝數檢測相對定量PCR服務絕對定量PCR服務熒光定量PCR服務整體課題服務SNP分型檢測服務SSR/STR技術服務病毒包裝服務CRISPR/Cas9技術試劑miRNA功能研究試劑lncRNA功能研究試劑環狀RNA功能研究試劑mRNA功能研究試劑發表文獻樣品準備服務流程基金申請
mRNA/lncRNA/環狀RNA三合一芯片
服務詳情

簡介

  近年的研究表明基因的轉錄調控受到多種模式的影響,其中microRNA調控是重要的調控模式。現已發現,基因的轉錄后調控并不是簡單的microRNA-mRNA的沉默機制,而是一個復雜的調控網絡:很多非編碼RNA分子富含microRNA結合位點,在細胞中起到miRNA海綿(miRNA sponge)的作用,進而解除miRNA對其靶基因的抑制作用,升高靶基因的表達水平,這一作用機制被稱為競爭性內源RNA(ceRNA)機制。而在ceRNA機制中,circRNA和lncRNA是最典型的miRNA海綿吸附體。因此,深入了解基于circRNA和lncRNA的ceRNA調控機制,有助于我們更好的理解個體發育或疾病發生發展過程中的精細調控機制,也有利于提示我們circRNA或者lncRNA在藥物開發和疾病診治中的應用前景。

芯片特點

1、芯片同時覆蓋環狀RNA、lncRNA、mRNA。一份芯片數據同時提供三個層面的表達信息,circRNA和lncRNA作為典型的內源競爭性RNA,此款芯片可以讓您暢游ceRNA調控研究。

2、可同時檢測8萬多個個circRNA、7萬多個lncRNA、約2萬個mRNA;

3、circRNA所有探針設計基于最新最全的國際主流circRNA數據庫信息。

結果展示

1、lncRNA靶基因預測

基于位置和序列預測lncRNA 調控機制分為順式 (cis-)調控和反式(trans-)調控。尋找基因組位置在10kb 之內的 lncRNA-mRNA(cis-),以及lncRNA和mRNA(3' UTR)序列相似的lncRNA-mRNA對(trans-)。


2、lncRNA和mRNA共表達網絡圖(左邊為所有lncRNA,右邊為單個lncRNA)