细菌基因组完成图真菌基因组完成图微生物群落多样性宏基因组测序服务全长转录组测序第三代测序服务非靶向代谢组学靶向代谢组学脂质组学离子组学脂肪酸检测氨基酸检测代谢组学服务定量蛋白质组服务双向电泳服务修饰蛋白质组蛋白质芯片蛋白质谱鉴定蛋白互作检测Western Blot蛋白质组学服务高通量测序数据分析蛋白质组学数据分析代谢组学数据分析芯片数据分析GO/Pathway富集分析相关性和聚类分析共表达网络图靶基因预测调控网络图蛋白相互作用网络图生物信息学服务CRISPR/Cas9载体构建稳定细胞系构建服务模式生物制备服务CRISPR/Cas9技术服务甲基化测序服务甲基化芯片服务甲基化验证服务DNA甲基化服务lncRNA测序服务lncRNA芯片服务lncRNA定量PCR验证lncRNA过表达服务lncRNA抑制服务lncRNA技术服务miRNA测序服务miRNA芯片服务miRNA定量PCR验证miRNA过表达服务miRNA抑制服务miRNA靶基因验证服务miRNA技术服务环状RNA测序服务环状RNA芯片服务环状RNA定量PCR验证环状RNA过表达服务环状RNA抑制服务环状RNA技术服务转录组测序服务表达谱测序服务mRNA/lncRNA/环状RNA 三合一芯片表达谱芯片服务荧光定量PCR验证mRNA过表达服务mRNA抑制服务mRNA技术服务转录因子筛选服务抗体制备服务ChiP-Seq测序服务ChiP-qPCR技术服务EMSA技术服务luciferase 实验服务转录因子技术服务mRNA定量PCR检测miRNA定量PCR检测lncRNA定量PCR检测环状RNA定量PCR检测DNA拷贝数检测相对定量PCR服务绝对定量PCR服务荧光定量PCR服务整体课题服务SNP分型检测服务SSR/STR技术服务病毒包装服务CRISPR/Cas9技术试剂miRNA功能研究试剂lncRNA功能研究试剂环状RNA功能研究试剂mRNA功能研究试剂发表文献样品准备服务流程基金申请
mRNA/lncRNA/环状RNA三合一芯片
服务详情

简介

  近年的研究表明基因的转录调控受到多种模式的影响,其中microRNA调控是重要的调控模式。现已发现,基因的转录后调控并不是简单的microRNA-mRNA的沉默机制,而是一个复杂的调控网络:很多非编码RNA分子富含microRNA结合位点,在细胞中起到miRNA海绵(miRNA sponge)的作用,进而解除miRNA对其靶基因的抑制作用,升高靶基因的表达水平,这一作用机制被称为竞争性内源RNA(ceRNA)机制。而在ceRNA机制中,circRNA和lncRNA是最典型的miRNA海绵吸附体。因此,深入了解基于circRNA和lncRNA的ceRNA调控机制,有助于我们更好的理解个体发育或疾病发生发展过程中的精细调控机制,也有利于提示我们circRNA或者lncRNA在药物开发和疾病诊治中的应用前景。

芯片特点

1、芯片同时覆盖环状RNA、lncRNA、mRNA。一份芯片数据同时提供三个层面的表达信息,circRNA和lncRNA作为典型的内源竞争性RNA,此款芯片可以让您畅游ceRNA调控研究。

2、可同时检测8万多个个circRNA、7万多个lncRNA、约2万个mRNA;

3、circRNA所有探针设计基于最新最全的国际主流circRNA数据库信息。

结果展示

1、lncRNA靶基因预测

基于位置和序列预测lncRNA 调控机制分为顺式 (cis-)调控和反式(trans-)调控。寻找基因组位置在10kb 之内的 lncRNA-mRNA(cis-),以及lncRNA和mRNA(3' UTR)序列相似的lncRNA-mRNA对(trans-)。


2、lncRNA和mRNA共表达网络图(左边为所有lncRNA,右边为单个lncRNA)