细菌基因组完成图真菌基因组完成图微生物群落多样性宏基因组测序服务全长转录组测序第三代测序服务非靶向代谢组学靶向代谢组学脂质组学离子组学脂肪酸检测氨基酸检测代谢组学服务定量蛋白质组服务双向电泳服务修饰蛋白质组蛋白质芯片蛋白质谱鉴定蛋白互作检测Western Blot蛋白质组学服务高通量测序数据分析蛋白质组学数据分析代谢组学数据分析芯片数据分析GO/Pathway富集分析相关性和聚类分析共表达网络图靶基因预测调控网络图蛋白相互作用网络图生物信息学服务CRISPR/Cas9载体构建稳定细胞系构建服务模式生物制备服务CRISPR/Cas9技术服务甲基化测序服务甲基化芯片服务甲基化验证服务DNA甲基化服务lncRNA测序服务lncRNA芯片服务lncRNA定量PCR验证lncRNA过表达服务lncRNA抑制服务lncRNA技术服务miRNA测序服务miRNA芯片服务miRNA定量PCR验证miRNA过表达服务miRNA抑制服务miRNA靶基因验证服务miRNA技术服务环状RNA测序服务环状RNA芯片服务环状RNA定量PCR验证环状RNA过表达服务环状RNA抑制服务环状RNA技术服务转录组测序服务表达谱测序服务mRNA/lncRNA/环状RNA 三合一芯片表达谱芯片服务荧光定量PCR验证mRNA过表达服务mRNA抑制服务mRNA技术服务转录因子筛选服务抗体制备服务ChiP-Seq测序服务ChiP-qPCR技术服务EMSA技术服务luciferase 实验服务转录因子技术服务mRNA定量PCR检测miRNA定量PCR检测lncRNA定量PCR检测环状RNA定量PCR检测DNA拷贝数检测相对定量PCR服务绝对定量PCR服务荧光定量PCR服务整体课题服务SNP分型检测服务SSR/STR技术服务病毒包装服务CRISPR/Cas9技术试剂miRNA功能研究试剂lncRNA功能研究试剂环状RNA功能研究试剂mRNA功能研究试剂发表文献样品准备服务流程基金申请
表达谱测序服务
服务详情


简介

  基因表达谱测序为对组织或细胞在特定状态下产生的 mRNA进行高通量测序分析,得到基因差异表达的情况。测序法进行基因表达分析具有定量准确,重复性、特异性、灵敏性高的特点。与全转录组测序研究相比,表达谱测序采用单端或双端读长的策略,测序通量较小,成本较低;与芯片法相比,测序法具有无需样本序列信息即可实现任一物种已知和未知转录本差异研究的开放性特点,对低丰度转录本的检测具有灵敏性和特异性高的优点??突Э筛菔笛槟康?,灵活选择合适的测序深度,以达到对不同丰度转录本的检测要求。一般 10M~20M reads数的测序量即可检测到比芯片更多的差异基因。如果对低丰度表达基因的关注度高,建议至少测 30M以上的 reads。

技术路线

结果列表

1、测序数据评估与统计;

2、基因表达水平分析;

3、样品间差异比较分析;

4、GO/KEGG富集分析;

5、基因共表达网络构建;

6、蛋白互作网络分析

结果展示

1、GO功能分析

2、Pathway 富集分析红色标记为差异基因

3、差异基因共表达网络图

差异基因蛋白网络互作网络图

4、差异基因蛋白网络互作网络图

样品要求

1、总RNA:浓度≥200 ng/μl,总量≥10 μg;

2、组织样品:动物、植物、微生物总量大于300 mg的新鲜样品。

3、血液2ml以上,血清1ml以上。

4、保存在超低温冰箱中,利用干冰运输。

参考文献

1、Huan Chen, Fa-Wei Wang, Yuan-Yuan Dong, et al. Sequence mining and transcript profiling to explore differentially expressed genes associated with lipid biosynthesis during soybean seed development. BMC Plant Biology, 2012, 12: 122-136.

2、Vagmita Pabuwal, Mikki Boswell, Amanda Pasquali, et al. Transcriptomic analysis of cultured whale skin cells exposed to hexavalent chromium [Cr(VI)]. Aquatic Toxicology, 2013, 134-135: 74-81.