細菌基因組完成圖真菌基因組完成圖微生物群落多樣性宏基因組測序服務全長轉錄組測序第三代測序服務非靶向代謝組學靶向代謝組學脂質組學離子組學脂肪酸檢測氨基酸檢測代謝組學服務定量蛋白質組服務雙向電泳服務修飾蛋白質組蛋白質芯片蛋白質譜鑒定蛋白互作檢測Western Blot蛋白質組學服務高通量測序數據分析蛋白質組學數據分析代謝組學數據分析芯片數據分析GO/Pathway富集分析相關性和聚類分析共表達網絡圖靶基因預測調控網絡圖蛋白相互作用網絡圖生物信息學服務CRISPR/Cas9載體構建穩定細胞系構建服務模式生物制備服務CRISPR/Cas9技術服務甲基化測序服務甲基化芯片服務甲基化驗證服務DNA甲基化服務lncRNA測序服務lncRNA芯片服務lncRNA定量PCR驗證lncRNA過表達服務lncRNA抑制服務lncRNA技術服務miRNA測序服務miRNA芯片服務miRNA定量PCR驗證miRNA過表達服務miRNA抑制服務miRNA靶基因驗證服務miRNA技術服務環狀RNA測序服務環狀RNA芯片服務環狀RNA定量PCR驗證環狀RNA過表達服務環狀RNA抑制服務環狀RNA技術服務轉錄組測序服務表達譜測序服務mRNA/lncRNA/環狀RNA 三合一芯片表達譜芯片服務熒光定量PCR驗證mRNA過表達服務mRNA抑制服務mRNA技術服務轉錄因子篩選服務抗體制備服務ChiP-Seq測序服務ChiP-qPCR技術服務EMSA技術服務luciferase 實驗服務轉錄因子技術服務mRNA定量PCR檢測miRNA定量PCR檢測lncRNA定量PCR檢測環狀RNA定量PCR檢測DNA拷貝數檢測相對定量PCR服務絕對定量PCR服務熒光定量PCR服務整體課題服務SNP分型檢測服務SSR/STR技術服務病毒包裝服務CRISPR/Cas9技術試劑miRNA功能研究試劑lncRNA功能研究試劑環狀RNA功能研究試劑mRNA功能研究試劑發表文獻樣品準備服務流程基金申請
表達譜測序服務
服務詳情


簡介

  基因表達譜測序為對組織或細胞在特定狀態下產生的 mRNA進行高通量測序分析,得到基因差異表達的情況。測序法進行基因表達分析具有定量準確,重復性、特異性、靈敏性高的特點。與全轉錄組測序研究相比,表達譜測序采用單端或雙端讀長的策略,測序通量較小,成本較低;與芯片法相比,測序法具有無需樣本序列信息即可實現任一物種已知和未知轉錄本差異研究的開放性特點,對低豐度轉錄本的檢測具有靈敏性和特異性高的優點??突Э篩菔笛檳康?,靈活選擇合適的測序深度,以達到對不同豐度轉錄本的檢測要求。一般 10M~20M reads數的測序量即可檢測到比芯片更多的差異基因。如果對低豐度表達基因的關注度高,建議至少測 30M以上的 reads。

技術路線

結果列表

1、測序數據評估與統計;

2、基因表達水平分析;

3、樣品間差異比較分析;

4、GO/KEGG富集分析;

5、基因共表達網絡構建;

6、蛋白互作網絡分析

結果展示

1、GO功能分析

2、Pathway 富集分析紅色標記為差異基因

3、差異基因共表達網絡圖

差異基因蛋白網絡互作網絡圖

4、差異基因蛋白網絡互作網絡圖

樣品要求

1、總RNA:濃度≥200 ng/μl,總量≥10 μg;

2、組織樣品:動物、植物、微生物總量大于300 mg的新鮮樣品。

3、血液2ml以上,血清1ml以上。

4、保存在超低溫冰箱中,利用干冰運輸。

參考文獻

1、Huan Chen, Fa-Wei Wang, Yuan-Yuan Dong, et al. Sequence mining and transcript profiling to explore differentially expressed genes associated with lipid biosynthesis during soybean seed development. BMC Plant Biology, 2012, 12: 122-136.

2、Vagmita Pabuwal, Mikki Boswell, Amanda Pasquali, et al. Transcriptomic analysis of cultured whale skin cells exposed to hexavalent chromium [Cr(VI)]. Aquatic Toxicology, 2013, 134-135: 74-81.