细菌基因组完成图真菌基因组完成图微生物群落多样性宏基因组测序服务全长转录组测序第三代测序服务非靶向代谢组学靶向代谢组学脂质组学离子组学脂肪酸检测氨基酸检测代谢组学服务定量蛋白质组服务双向电泳服务修饰蛋白质组蛋白质芯片蛋白质谱鉴定蛋白互作检测Western Blot蛋白质组学服务高通量测序数据分析蛋白质组学数据分析代谢组学数据分析芯片数据分析GO/Pathway富集分析相关性和聚类分析共表达网络图靶基因预测调控网络图蛋白相互作用网络图生物信息学服务CRISPR/Cas9载体构建稳定细胞系构建服务模式生物制备服务CRISPR/Cas9技术服务甲基化测序服务甲基化芯片服务甲基化验证服务DNA甲基化服务lncRNA测序服务lncRNA芯片服务lncRNA定量PCR验证lncRNA过表达服务lncRNA抑制服务lncRNA技术服务miRNA测序服务miRNA芯片服务miRNA定量PCR验证miRNA过表达服务miRNA抑制服务miRNA靶基因验证服务miRNA技术服务环状RNA测序服务环状RNA芯片服务环状RNA定量PCR验证环状RNA过表达服务环状RNA抑制服务环状RNA技术服务转录组测序服务表达谱测序服务mRNA/lncRNA/环状RNA 三合一芯片表达谱芯片服务荧光定量PCR验证mRNA过表达服务mRNA抑制服务mRNA技术服务转录因子筛选服务抗体制备服务ChiP-Seq测序服务ChiP-qPCR技术服务EMSA技术服务luciferase 实验服务转录因子技术服务mRNA定量PCR检测miRNA定量PCR检测lncRNA定量PCR检测环状RNA定量PCR检测DNA拷贝数检测相对定量PCR服务绝对定量PCR服务荧光定量PCR服务整体课题服务SNP分型检测服务SSR/STR技术服务病毒包装服务CRISPR/Cas9技术试剂miRNA功能研究试剂lncRNA功能研究试剂环状RNA功能研究试剂mRNA功能研究试剂发表文献样品准备服务流程基金申请
miRNA测序服务
服务详情


  简介


       Small RNA是一类重要的体内调节分子,长度在18-30nt之间,主要包括miRNA、piRNAsiRNA。它的功能主要是诱导基因沉默,参与基因转录后调控,从而调节细胞生长、分化,以及个体发育、生殖等重要生物学过程。高通量测序技术可以对样本中所有small RNA家族进行测序和表达定量,从而解析miRNA、siRNA、piRNA和其它非编码RNA以及相应靶序列。

    一、技术路线

    二、数据分析内容

    1原始数据产出统计

    2已知 small RNA注释:miRNA, siRNA, PiRNA, snoRNA,rRNA

    3miRNA 长度分布分析

    4预测新的 miRNA

    5miRNA同源性结构分析

    6miRNA表达谱聚类分析

    7miRNA差异表达分析

    8miRNA靶基因预测

    9靶基因PathwayGene Onlotogy富集分析

    10mRNA进行关联分析(需要有mRNA数据)

    三、结果示例

    1、序列长度分析

    2、预测新miRNA

    3、靶基因调控图


    四、样品要求

    1、总RNA:浓度≥200 ng/μl,总量≥10 μg;

    2、组织样品:动物、植物、微生物总量大于300 mg的新鲜样品。

    3、血液2ml以上,血清1ml以上。

    4、保存在超低温冰箱中,利用干冰运输。

    、参考文献

    1、Carol Ying-Ying Szeto, Chi Ho Lin, Siu Chung Choi, et al. Integrated mRNA and microRNA transcriptome sequencing characterizes sequence variants and mRNA–microRNA regulatory network in nasopharyngeal carcinoma model systems. FEBS OpenBio, 2014, 4: 128–140

    2、Wang X, Yang L, Wang H, Shao F, Yu J, et al. (2014) Growth Hormone-Regulated mRNAs and miRNAs in Chicken Hepatocytes. PLoS ONE, 9(11): e112896