細菌基因組完成圖真菌基因組完成圖微生物群落多樣性宏基因組測序服務全長轉錄組測序第三代測序服務非靶向代謝組學靶向代謝組學脂質組學離子組學脂肪酸檢測氨基酸檢測代謝組學服務定量蛋白質組服務雙向電泳服務修飾蛋白質組蛋白質芯片蛋白質譜鑒定蛋白互作檢測Western Blot蛋白質組學服務高通量測序數據分析蛋白質組學數據分析代謝組學數據分析芯片數據分析GO/Pathway富集分析相關性和聚類分析共表達網絡圖靶基因預測調控網絡圖蛋白相互作用網絡圖生物信息學服務CRISPR/Cas9載體構建穩定細胞系構建服務模式生物制備服務CRISPR/Cas9技術服務甲基化測序服務甲基化芯片服務甲基化驗證服務DNA甲基化服務lncRNA測序服務lncRNA芯片服務lncRNA定量PCR驗證lncRNA過表達服務lncRNA抑制服務lncRNA技術服務miRNA測序服務miRNA芯片服務miRNA定量PCR驗證miRNA過表達服務miRNA抑制服務miRNA靶基因驗證服務miRNA技術服務環狀RNA測序服務環狀RNA芯片服務環狀RNA定量PCR驗證環狀RNA過表達服務環狀RNA抑制服務環狀RNA技術服務轉錄組測序服務表達譜測序服務mRNA/lncRNA/環狀RNA 三合一芯片表達譜芯片服務熒光定量PCR驗證mRNA過表達服務mRNA抑制服務mRNA技術服務轉錄因子篩選服務抗體制備服務ChiP-Seq測序服務ChiP-qPCR技術服務EMSA技術服務luciferase 實驗服務轉錄因子技術服務mRNA定量PCR檢測miRNA定量PCR檢測lncRNA定量PCR檢測環狀RNA定量PCR檢測DNA拷貝數檢測相對定量PCR服務絕對定量PCR服務熒光定量PCR服務整體課題服務SNP分型檢測服務SSR/STR技術服務病毒包裝服務CRISPR/Cas9技術試劑miRNA功能研究試劑lncRNA功能研究試劑環狀RNA功能研究試劑mRNA功能研究試劑發表文獻樣品準備服務流程基金申請
miRNA測序服務
服務詳情


  簡介


       Small RNA是一類重要的體內調節分子,長度在18-30nt之間,主要包括miRNA、piRNAsiRNA。它的功能主要是誘導基因沉默,參與基因轉錄后調控,從而調節細胞生長、分化,以及個體發育、生殖等重要生物學過程。高通量測序技術可以對樣本中所有small RNA家族進行測序和表達定量,從而解析miRNA、siRNA、piRNA和其它非編碼RNA以及相應靶序列。

    一、技術路線

    二、數據分析內容

    1原始數據產出統計

    2已知 small RNA注釋:miRNA, siRNA, PiRNA, snoRNA,rRNA

    3miRNA 長度分布分析

    4預測新的 miRNA

    5miRNA同源性結構分析

    6miRNA表達譜聚類分析

    7miRNA差異表達分析

    8miRNA靶基因預測

    9靶基因PathwayGene Onlotogy富集分析

    10mRNA進行關聯分析(需要有mRNA數據)

    三、結果示例

    1、序列長度分析

    2、預測新miRNA

    3、靶基因調控圖


    四、樣品要求

    1、總RNA:濃度≥200 ng/μl,總量≥10 μg;

    2、組織樣品:動物、植物、微生物總量大于300 mg的新鮮樣品。

    3、血液2ml以上,血清1ml以上。

    4、保存在超低溫冰箱中,利用干冰運輸。

    、參考文獻

    1、Carol Ying-Ying Szeto, Chi Ho Lin, Siu Chung Choi, et al. Integrated mRNA and microRNA transcriptome sequencing characterizes sequence variants and mRNA–microRNA regulatory network in nasopharyngeal carcinoma model systems. FEBS OpenBio, 2014, 4: 128–140

    2、Wang X, Yang L, Wang H, Shao F, Yu J, et al. (2014) Growth Hormone-Regulated mRNAs and miRNAs in Chicken Hepatocytes. PLoS ONE, 9(11): e112896