细菌基因组完成图真菌基因组完成图微生物群落多样性宏基因组测序服务全长转录组测序第三代测序服务非靶向代谢组学靶向代谢组学脂质组学离子组学脂肪酸检测氨基酸检测代谢组学服务定量蛋白质组服务双向电泳服务修饰蛋白质组蛋白质芯片蛋白质谱鉴定蛋白互作检测Western Blot蛋白质组学服务高通量测序数据分析蛋白质组学数据分析代谢组学数据分析芯片数据分析GO/Pathway富集分析相关性和聚类分析共表达网络图靶基因预测调控网络图蛋白相互作用网络图生物信息学服务CRISPR/Cas9载体构建稳定细胞系构建服务模式生物制备服务CRISPR/Cas9技术服务甲基化测序服务甲基化芯片服务甲基化验证服务DNA甲基化服务lncRNA测序服务lncRNA芯片服务lncRNA定量PCR验证lncRNA过表达服务lncRNA抑制服务lncRNA技术服务miRNA测序服务miRNA芯片服务miRNA定量PCR验证miRNA过表达服务miRNA抑制服务miRNA靶基因验证服务miRNA技术服务环状RNA测序服务环状RNA芯片服务环状RNA定量PCR验证环状RNA过表达服务环状RNA抑制服务环状RNA技术服务转录组测序服务表达谱测序服务mRNA/lncRNA/环状RNA 三合一芯片表达谱芯片服务荧光定量PCR验证mRNA过表达服务mRNA抑制服务mRNA技术服务转录因子筛选服务抗体制备服务ChiP-Seq测序服务ChiP-qPCR技术服务EMSA技术服务luciferase 实验服务转录因子技术服务mRNA定量PCR检测miRNA定量PCR检测lncRNA定量PCR检测环状RNA定量PCR检测DNA拷贝数检测相对定量PCR服务绝对定量PCR服务荧光定量PCR服务整体课题服务SNP分型检测服务SSR/STR技术服务病毒包装服务CRISPR/Cas9技术试剂miRNA功能研究试剂lncRNA功能研究试剂环状RNA功能研究试剂mRNA功能研究试剂发表文献样品准备服务流程基金申请
甲基化测序服务
服务详情


简介

  MeDIP-Seq是基于免疫富集原理进行的全基因组DNA甲基化研究方法,通过5"-甲基胞嘧啶(5mC)抗体将基因组中的DNA甲基化区域富集后进行高通量测序,从而检测基因组上高CpG区域的甲基化位点。通过MeDIP-Seq技术可以快速准确地寻找样品间相对DNA甲基化差异区域,进行不同细胞、组织样本间的DNA甲基化修饰模式的差异分析,该方法可以高效、经济地比较大样本量细胞、组织等样品间的相对甲基化差异,且成本较低,适合大样本量表观遗传学的研究。言行生物还提供WGBS/RRBS甲基化测序服务,质量高。



一、技术路线



二、生物信息分析

1、原始数据产出统计。    

2、MeDIP-Seq序列与参考序列比对。    

3、统计 reads在全基因组的分布情况。    

4、统计 reads在CpG区域的分布情况。    

5、统计 reads在不同功能元件区域(Promoter,UTR,Exon,Intron)的分布情况。    

6、统计 reads在不同 GC含量区域中的分布情况。    

7、统计序列富集区域(peak)。    

8、统计与 peak相关的基因。    

9、统计 peak在不同功能元件区域(Promoter,UTR,Exon,Intron)的分布情况。  

10、多样本 peak差异分析及差异 peak相关基因注释、 GO分类和 pathway显著性富集分析。  

11、与表达谱进行关联分析,预测甲基化调控基因(需有表达谱数据)。  

12、MeDIP-Seq数据可视化分析:生成 Genome Browser可以导入的文件。


三、结果展示

1、reads在CpG、Promoter和基因组的分布

2、peak在不同功能元件区域的分布


3、差异peak列表


4、差异peak比较图


四、样品要求

1、样品类型:血液、细胞、新鲜组织或DNA样品。    

2、样品量:细胞样品请提供至少2×107个细胞,组织样品请提供至少100mg的组织块或切片,DNA样品请提供10 μg以上。