細菌基因組完成圖真菌基因組完成圖微生物群落多樣性宏基因組測序服務全長轉錄組測序第三代測序服務非靶向代謝組學靶向代謝組學脂質組學離子組學脂肪酸檢測氨基酸檢測代謝組學服務定量蛋白質組服務雙向電泳服務修飾蛋白質組蛋白質芯片蛋白質譜鑒定蛋白互作檢測Western Blot蛋白質組學服務高通量測序數據分析蛋白質組學數據分析代謝組學數據分析芯片數據分析GO/Pathway富集分析相關性和聚類分析共表達網絡圖靶基因預測調控網絡圖蛋白相互作用網絡圖生物信息學服務CRISPR/Cas9載體構建穩定細胞系構建服務模式生物制備服務CRISPR/Cas9技術服務甲基化測序服務甲基化芯片服務甲基化驗證服務DNA甲基化服務lncRNA測序服務lncRNA芯片服務lncRNA定量PCR驗證lncRNA過表達服務lncRNA抑制服務lncRNA技術服務miRNA測序服務miRNA芯片服務miRNA定量PCR驗證miRNA過表達服務miRNA抑制服務miRNA靶基因驗證服務miRNA技術服務環狀RNA測序服務環狀RNA芯片服務環狀RNA定量PCR驗證環狀RNA過表達服務環狀RNA抑制服務環狀RNA技術服務轉錄組測序服務表達譜測序服務mRNA/lncRNA/環狀RNA 三合一芯片表達譜芯片服務熒光定量PCR驗證mRNA過表達服務mRNA抑制服務mRNA技術服務轉錄因子篩選服務抗體制備服務ChiP-Seq測序服務ChiP-qPCR技術服務EMSA技術服務luciferase 實驗服務轉錄因子技術服務mRNA定量PCR檢測miRNA定量PCR檢測lncRNA定量PCR檢測環狀RNA定量PCR檢測DNA拷貝數檢測相對定量PCR服務絕對定量PCR服務熒光定量PCR服務整體課題服務SNP分型檢測服務SSR/STR技術服務病毒包裝服務CRISPR/Cas9技術試劑miRNA功能研究試劑lncRNA功能研究試劑環狀RNA功能研究試劑mRNA功能研究試劑發表文獻樣品準備服務流程基金申請
甲基化測序服務
服務詳情


簡介

  MeDIP-Seq是基于免疫富集原理進行的全基因組DNA甲基化研究方法,通過5"-甲基胞嘧啶(5mC)抗體將基因組中的DNA甲基化區域富集后進行高通量測序,從而檢測基因組上高CpG區域的甲基化位點。通過MeDIP-Seq技術可以快速準確地尋找樣品間相對DNA甲基化差異區域,進行不同細胞、組織樣本間的DNA甲基化修飾模式的差異分析,該方法可以高效、經濟地比較大樣本量細胞、組織等樣品間的相對甲基化差異,且成本較低,適合大樣本量表觀遺傳學的研究。言行生物還提供WGBS/RRBS甲基化測序服務,質量高。



一、技術路線



二、生物信息分析

1、原始數據產出統計。    

2、MeDIP-Seq序列與參考序列比對。    

3、統計 reads在全基因組的分布情況。    

4、統計 reads在CpG區域的分布情況。    

5、統計 reads在不同功能元件區域(Promoter,UTR,Exon,Intron)的分布情況。    

6、統計 reads在不同 GC含量區域中的分布情況。    

7、統計序列富集區域(peak)。    

8、統計與 peak相關的基因。    

9、統計 peak在不同功能元件區域(Promoter,UTR,Exon,Intron)的分布情況。  

10、多樣本 peak差異分析及差異 peak相關基因注釋、 GO分類和 pathway顯著性富集分析。  

11、與表達譜進行關聯分析,預測甲基化調控基因(需有表達譜數據)。  

12、MeDIP-Seq數據可視化分析:生成 Genome Browser可以導入的文件。


三、結果展示

1、reads在CpG、Promoter和基因組的分布

2、peak在不同功能元件區域的分布


3、差異peak列表


4、差異peak比較圖


四、樣品要求

1、樣品類型:血液、細胞、新鮮組織或DNA樣品。    

2、樣品量:細胞樣品請提供至少2×107個細胞,組織樣品請提供至少100mg的組織塊或切片,DNA樣品請提供10 μg以上。