细菌基因组完成图真菌基因组完成图微生物群落多样性宏基因组测序服务全长转录组测序第三代测序服务非靶向代谢组学靶向代谢组学脂质组学离子组学脂肪酸检测氨基酸检测代谢组学服务定量蛋白质组服务双向电泳服务修饰蛋白质组蛋白质芯片蛋白质谱鉴定蛋白互作检测Western Blot蛋白质组学服务高通量测序数据分析蛋白质组学数据分析代谢组学数据分析芯片数据分析GO/Pathway富集分析相关性和聚类分析共表达网络图靶基因预测调控网络图蛋白相互作用网络图生物信息学服务CRISPR/Cas9载体构建稳定细胞系构建服务模式生物制备服务CRISPR/Cas9技术服务甲基化测序服务甲基化芯片服务甲基化验证服务DNA甲基化服务lncRNA测序服务lncRNA芯片服务lncRNA定量PCR验证lncRNA过表达服务lncRNA抑制服务lncRNA技术服务miRNA测序服务miRNA芯片服务miRNA定量PCR验证miRNA过表达服务miRNA抑制服务miRNA靶基因验证服务miRNA技术服务环状RNA测序服务环状RNA芯片服务环状RNA定量PCR验证环状RNA过表达服务环状RNA抑制服务环状RNA技术服务转录组测序服务表达谱测序服务mRNA/lncRNA/环状RNA 三合一芯片表达谱芯片服务荧光定量PCR验证mRNA过表达服务mRNA抑制服务mRNA技术服务转录因子筛选服务抗体制备服务ChiP-Seq测序服务ChiP-qPCR技术服务EMSA技术服务luciferase 实验服务转录因子技术服务mRNA定量PCR检测miRNA定量PCR检测lncRNA定量PCR检测环状RNA定量PCR检测DNA拷贝数检测相对定量PCR服务绝对定量PCR服务荧光定量PCR服务整体课题服务SNP分型检测服务SSR/STR技术服务病毒包装服务CRISPR/Cas9技术试剂miRNA功能研究试剂lncRNA功能研究试剂环状RNA功能研究试剂mRNA功能研究试剂发表文献样品准备服务流程基金申请
蛋白质组学数据分析
服务详情

  言行生物可以对定量蛋白质组学数据、修饰蛋白质组学数据、双向电泳结果等数据进行各种系统化和个性化的生物信息学分析。

结果展示

1、GO功能分析

在蛋白组学中,对大规模的鉴定结果经常用pie图或bar图表示蛋白的某个分类,如亚细胞定位、生物功能、生物通路等。

        说明:Bar图表示鉴定蛋白在分子功能上的富集度。

通过一般数据库查询给出特定蛋白的GO信息烦多,很难进行统计分类。我们可以将所有鉴定蛋白的GO都slim到特定的GO分类上,便于下一步的统计和图示化。

      说明:Pie图表示鉴定蛋白在亚细胞定位上的分类。

2、Pathway通路分析

对已鉴定蛋白可以mapping到通路数据库中,给出mapping的统计结果并图示化。

    说明:蛋白标记定量数据在KEGG通路图中的mapping

3、网络分析

通过蛋白的差异谱或实际鉴定谱,可以在各种相互作用数据库中找到对应的相互作用蛋白,并构画出相互作用网络。

     说明:鉴定蛋白构建相互作用网络。

     说明:鉴定蛋白构建Transfac转录调控网络。

4、聚类分析

    说明:用聚类热图展示蛋白相对定量数据中表达趋势相近的蛋白?


5、修饰蛋白质组学研究

蛋白特定的修饰鉴定后,想挖掘修饰位点附近氨基酸组成的状况,可以用聚类图或氨基酸比例图展现。

  说明:用热图形式展示靶标修饰氨基酸附近的氨基酸组成情况

  说明:用概率图形式展示靶标修饰氨基酸附近的氨基酸组成情况 ?

6、IPA 分析 (商业软件,需要license)

IPA是一种公认的生物数据分析工具,非常适用于疾病相关的数据分析。它的主要特色在于根据实际数据找到疾病分子的网络和通路,甚至在其基础之上构建自己的网络和通路。

说明:IPA捕捉到差异分子形成网络。

7、GSEA 分析

可以结合表达量的数据找到相关的基因集合。此处,基因集合泛指包含一堆基因的类别名称,可以是GO中的某一类,通路中的某一条或转录调控和相互作用网络中的某个小???。

说明:GSEA捕捉到差异分子的基因集合