細菌基因組完成圖真菌基因組完成圖微生物群落多樣性宏基因組測序服務全長轉錄組測序第三代測序服務非靶向代謝組學靶向代謝組學脂質組學離子組學脂肪酸檢測氨基酸檢測代謝組學服務定量蛋白質組服務雙向電泳服務修飾蛋白質組蛋白質芯片蛋白質譜鑒定蛋白互作檢測Western Blot蛋白質組學服務高通量測序數據分析蛋白質組學數據分析代謝組學數據分析芯片數據分析GO/Pathway富集分析相關性和聚類分析共表達網絡圖靶基因預測調控網絡圖蛋白相互作用網絡圖生物信息學服務CRISPR/Cas9載體構建穩定細胞系構建服務模式生物制備服務CRISPR/Cas9技術服務甲基化測序服務甲基化芯片服務甲基化驗證服務DNA甲基化服務lncRNA測序服務lncRNA芯片服務lncRNA定量PCR驗證lncRNA過表達服務lncRNA抑制服務lncRNA技術服務miRNA測序服務miRNA芯片服務miRNA定量PCR驗證miRNA過表達服務miRNA抑制服務miRNA靶基因驗證服務miRNA技術服務環狀RNA測序服務環狀RNA芯片服務環狀RNA定量PCR驗證環狀RNA過表達服務環狀RNA抑制服務環狀RNA技術服務轉錄組測序服務表達譜測序服務mRNA/lncRNA/環狀RNA 三合一芯片表達譜芯片服務熒光定量PCR驗證mRNA過表達服務mRNA抑制服務mRNA技術服務轉錄因子篩選服務抗體制備服務ChiP-Seq測序服務ChiP-qPCR技術服務EMSA技術服務luciferase 實驗服務轉錄因子技術服務mRNA定量PCR檢測miRNA定量PCR檢測lncRNA定量PCR檢測環狀RNA定量PCR檢測DNA拷貝數檢測相對定量PCR服務絕對定量PCR服務熒光定量PCR服務整體課題服務SNP分型檢測服務SSR/STR技術服務病毒包裝服務CRISPR/Cas9技術試劑miRNA功能研究試劑lncRNA功能研究試劑環狀RNA功能研究試劑mRNA功能研究試劑發表文獻樣品準備服務流程基金申請
蛋白質組學數據分析
服務詳情

  言行生物可以對定量蛋白質組學數據、修飾蛋白質組學數據、雙向電泳結果等數據進行各種系統化和個性化的生物信息學分析。

結果展示

1、GO功能分析

在蛋白組學中,對大規模的鑒定結果經常用pie圖或bar圖表示蛋白的某個分類,如亞細胞定位、生物功能、生物通路等。

        說明:Bar圖表示鑒定蛋白在分子功能上的富集度。

通過一般數據庫查詢給出特定蛋白的GO信息煩多,很難進行統計分類。我們可以將所有鑒定蛋白的GO都slim到特定的GO分類上,便于下一步的統計和圖示化。

      說明:Pie圖表示鑒定蛋白在亞細胞定位上的分類。

2、Pathway通路分析

對已鑒定蛋白可以mapping到通路數據庫中,給出mapping的統計結果并圖示化。

    說明:蛋白標記定量數據在KEGG通路圖中的mapping

3、網絡分析

通過蛋白的差異譜或實際鑒定譜,可以在各種相互作用數據庫中找到對應的相互作用蛋白,并構畫出相互作用網絡。

     說明:鑒定蛋白構建相互作用網絡。

     說明:鑒定蛋白構建Transfac轉錄調控網絡。

4、聚類分析

    說明:用聚類熱圖展示蛋白相對定量數據中表達趨勢相近的蛋白?


5、修飾蛋白質組學研究

蛋白特定的修飾鑒定后,想挖掘修飾位點附近氨基酸組成的狀況,可以用聚類圖或氨基酸比例圖展現。

  說明:用熱圖形式展示靶標修飾氨基酸附近的氨基酸組成情況

  說明:用概率圖形式展示靶標修飾氨基酸附近的氨基酸組成情況 ?

6、IPA 分析 (商業軟件,需要license)

IPA是一種公認的生物數據分析工具,非常適用于疾病相關的數據分析。它的主要特色在于根據實際數據找到疾病分子的網絡和通路,甚至在其基礎之上構建自己的網絡和通路。

說明:IPA捕捉到差異分子形成網絡。

7、GSEA 分析

可以結合表達量的數據找到相關的基因集合。此處,基因集合泛指包含一堆基因的類別名稱,可以是GO中的某一類,通路中的某一條或轉錄調控和相互作用網絡中的某個小???。

說明:GSEA捕捉到差異分子的基因集合