細菌基因組完成圖真菌基因組完成圖微生物群落多樣性宏基因組測序服務全長轉錄組測序第三代測序服務非靶向代謝組學靶向代謝組學脂質組學離子組學脂肪酸檢測氨基酸檢測代謝組學服務定量蛋白質組服務雙向電泳服務修飾蛋白質組蛋白質芯片蛋白質譜鑒定蛋白互作檢測Western Blot蛋白質組學服務高通量測序數據分析蛋白質組學數據分析代謝組學數據分析芯片數據分析GO/Pathway富集分析相關性和聚類分析共表達網絡圖靶基因預測調控網絡圖蛋白相互作用網絡圖生物信息學服務CRISPR/Cas9載體構建穩定細胞系構建服務模式生物制備服務CRISPR/Cas9技術服務甲基化測序服務甲基化芯片服務甲基化驗證服務DNA甲基化服務lncRNA測序服務lncRNA芯片服務lncRNA定量PCR驗證lncRNA過表達服務lncRNA抑制服務lncRNA技術服務miRNA測序服務miRNA芯片服務miRNA定量PCR驗證miRNA過表達服務miRNA抑制服務miRNA靶基因驗證服務miRNA技術服務環狀RNA測序服務環狀RNA芯片服務環狀RNA定量PCR驗證環狀RNA過表達服務環狀RNA抑制服務環狀RNA技術服務轉錄組測序服務表達譜測序服務mRNA/lncRNA/環狀RNA 三合一芯片表達譜芯片服務熒光定量PCR驗證mRNA過表達服務mRNA抑制服務mRNA技術服務轉錄因子篩選服務抗體制備服務ChiP-Seq測序服務ChiP-qPCR技術服務EMSA技術服務luciferase 實驗服務轉錄因子技術服務mRNA定量PCR檢測miRNA定量PCR檢測lncRNA定量PCR檢測環狀RNA定量PCR檢測DNA拷貝數檢測相對定量PCR服務絕對定量PCR服務熒光定量PCR服務整體課題服務SNP分型檢測服務SSR/STR技術服務病毒包裝服務CRISPR/Cas9技術試劑miRNA功能研究試劑lncRNA功能研究試劑環狀RNA功能研究試劑mRNA功能研究試劑發表文獻樣品準備服務流程基金申請
定量蛋白質組服務
服務詳情


簡介

      iTRAQ和TMT是目前運用最廣泛的兩種標記定量蛋白質組技術,分別通過與氨基酸末端氨基以及賴氨酸殘基的游離氨基結合,實現對多肽的標記,并通過不同分子量的試劑對不同來源樣品進行標記的方式實現不同樣品間蛋白質組比較的目標。以iTRAQ試劑為例,該試劑結構由指示基團、中性平衡基團和反應基團三部分組成。不同指示基團及其相對應平衡基團的質量和都相同,而反應基團能與賴氨酸ε氨基和所有肽鏈的氨基末端連接,可標記所有氨基酸。不同標記試劑與來源于不同樣品胰酶消化后的肽段結合,經過色譜分離,并通過一級質譜和二級質譜。平衡基團在二級質譜時發生中性丟失,而報告基團在二級質譜低質量區域產生多個報告離子,其信號強度分別代表該標記樣品的表達量,根據報告離子的峰面積計算同一蛋白質同一肽段在不同樣品間的比值,從而實現蛋白的相對和絕對定量。

技術路線

技術優勢

1、靈敏度高,檢測限低,可檢測出低豐度蛋白;    

 2、分離能力強,分析范圍廣,iTRAQ和TMT可以對任何類型的蛋白質進行分離鑒定,包括高分子量蛋白質、酸性蛋白和堿性蛋白,膜蛋白和不溶性蛋白;

 3、高通量:同時對8個或6個樣本進行分析,提高了實驗通量,可同時對多個時間點或不同處理的蛋白質進行分析;  

 4、結果可靠:定性與定量分析結果更加可靠;    

 5、自動化程度高:液相與質譜連用,自動化操作,分析速度快,分離效果好。

結果示例

1、差異蛋白列表(紅色字體為差異上調的蛋白,綠色字體為差異下調的蛋白)



2、差異蛋白的GO功能分析


3、差異蛋白的Pathway分析



4、差異蛋白的相互作用網絡圖



樣品要求

1、植物樣本組織100mg以上,血液樣品至少1ml,血清0.5ml,體液1ml,細胞樣品為5×106個細胞,酵母、微生物等干重100mg以上。

2、樣品保存與運輸:在液氮或-80°C保存。干冰運輸。



參考文獻

1、iTRAQ plus 18O: A new technique for target glycoprotein analysis ,  Talanta, Volume 91, 15 March 2012, Pages 122-127(方法學)

2、Identification of transaldolaseas a novel serum biomarker for hepatocellular carcinoma metastasis using xenografted mouse modeland clinic samples , Cancer Letters 313 (2011) 154–166 IF 4.8,血清樣本)

3、iTRAQ2DLCESIMS/MS Based Identification of a New Set ofimmunohistochemical Biomarkers forClassification of Dysplastic Nodules and SmallHepatocellular Carcinoma,J. Proteome Res. 2011, 10, 3418–3428IF5.12,組織樣本)

4、Analysis of Transcriptional Factors and Regulation Networks in     Patients with Acute Renal Allograft RejectionJournal of Proteome Research 2011, 10, 175–181IF5.12,血清樣本)

5、Changes in proteomics profile during maturation of  marrow-derived  dendritic  cells treated with oxidized  low-density lipoprotein Proteomics 2011, 11, 1893–190IF 4.42,細胞樣本)

6、LC-MS/MS Analysis of Ovarian Cancer Metastasis-Related Proteins Using a Nude Mouse Model: 14-3-3 Zeta as a Candidate BiomarkerJ. Proteome Res., 2010,   6180–6190IF5.12,囊液樣本)