细菌基因组完成图真菌基因组完成图微生物群落多样性宏基因组测序服务全长转录组测序第三代测序服务非靶向代谢组学靶向代谢组学脂质组学离子组学脂肪酸检测氨基酸检测代谢组学服务定量蛋白质组服务双向电泳服务修饰蛋白质组蛋白质芯片蛋白质谱鉴定蛋白互作检测Western Blot蛋白质组学服务高通量测序数据分析蛋白质组学数据分析代谢组学数据分析芯片数据分析GO/Pathway富集分析相关性和聚类分析共表达网络图靶基因预测调控网络图蛋白相互作用网络图生物信息学服务CRISPR/Cas9载体构建稳定细胞系构建服务模式生物制备服务CRISPR/Cas9技术服务甲基化测序服务甲基化芯片服务甲基化验证服务DNA甲基化服务lncRNA测序服务lncRNA芯片服务lncRNA定量PCR验证lncRNA过表达服务lncRNA抑制服务lncRNA技术服务miRNA测序服务miRNA芯片服务miRNA定量PCR验证miRNA过表达服务miRNA抑制服务miRNA靶基因验证服务miRNA技术服务环状RNA测序服务环状RNA芯片服务环状RNA定量PCR验证环状RNA过表达服务环状RNA抑制服务环状RNA技术服务转录组测序服务表达谱测序服务mRNA/lncRNA/环状RNA 三合一芯片表达谱芯片服务荧光定量PCR验证mRNA过表达服务mRNA抑制服务mRNA技术服务转录因子筛选服务抗体制备服务ChiP-Seq测序服务ChiP-qPCR技术服务EMSA技术服务luciferase 实验服务转录因子技术服务mRNA定量PCR检测miRNA定量PCR检测lncRNA定量PCR检测环状RNA定量PCR检测DNA拷贝数检测相对定量PCR服务绝对定量PCR服务荧光定量PCR服务整体课题服务SNP分型检测服务SSR/STR技术服务病毒包装服务CRISPR/Cas9技术试剂miRNA功能研究试剂lncRNA功能研究试剂环状RNA功能研究试剂mRNA功能研究试剂发表文献样品准备服务流程基金申请
定量蛋白质组服务
服务详情


简介

      iTRAQ和TMT是目前运用最广泛的两种标记定量蛋白质组技术,分别通过与氨基酸末端氨基以及赖氨酸残基的游离氨基结合,实现对多肽的标记,并通过不同分子量的试剂对不同来源样品进行标记的方式实现不同样品间蛋白质组比较的目标。以iTRAQ试剂为例,该试剂结构由指示基团、中性平衡基团和反应基团三部分组成。不同指示基团及其相对应平衡基团的质量和都相同,而反应基团能与赖氨酸ε氨基和所有肽链的氨基末端连接,可标记所有氨基酸。不同标记试剂与来源于不同样品胰酶消化后的肽段结合,经过色谱分离,并通过一级质谱和二级质谱。平衡基团在二级质谱时发生中性丢失,而报告基团在二级质谱低质量区域产生多个报告离子,其信号强度分别代表该标记样品的表达量,根据报告离子的峰面积计算同一蛋白质同一肽段在不同样品间的比值,从而实现蛋白的相对和绝对定量。

体育彩票36选7开奖查询 www.xhkvu.com

技术路线

技术优势

1、灵敏度高,检测限低,可检测出低丰度蛋白;    

 2、分离能力强,分析范围广,iTRAQ和TMT可以对任何类型的蛋白质进行分离鉴定,包括高分子量蛋白质、酸性蛋白和碱性蛋白,膜蛋白和不溶性蛋白;

 3、高通量:同时对8个或6个样本进行分析,提高了实验通量,可同时对多个时间点或不同处理的蛋白质进行分析;  

 4、结果可靠:定性与定量分析结果更加可靠;    

 5、自动化程度高:液相与质谱连用,自动化操作,分析速度快,分离效果好。

结果示例

1、差异蛋白列表(红色字体为差异上调的蛋白,绿色字体为差异下调的蛋白)



2、差异蛋白的GO功能分析


3、差异蛋白的Pathway分析



4、差异蛋白的相互作用网络图



样品要求

1、植物样本组织100mg以上,血液样品至少1ml,血清0.5ml,体液1ml,细胞样品为5×106个细胞,酵母、微生物等干重100mg以上。

2、样品保存与运输:在液氮或-80°C保存。干冰运输。



参考文献

1、iTRAQ plus 18O: A new technique for target glycoprotein analysis ,  Talanta, Volume 91, 15 March 2012, Pages 122-127(方法学)

2、Identification of transaldolaseas a novel serum biomarker for hepatocellular carcinoma metastasis using xenografted mouse modeland clinic samples , Cancer Letters 313 (2011) 154–166 IF 4.8,血清样本)

3、iTRAQ2DLCESIMS/MS Based Identification of a New Set ofimmunohistochemical Biomarkers forClassification of Dysplastic Nodules and SmallHepatocellular Carcinoma,J. Proteome Res. 2011, 10, 3418–3428IF5.12,组织样本)

4、Analysis of Transcriptional Factors and Regulation Networks in     Patients with Acute Renal Allograft RejectionJournal of Proteome Research 2011, 10, 175–181IF5.12,血清样本)

5、Changes in proteomics profile during maturation of  marrow-derived  dendritic  cells treated with oxidized  low-density lipoprotein Proteomics 2011, 11, 1893–190IF 4.42,细胞样本)

6、LC-MS/MS Analysis of Ovarian Cancer Metastasis-Related Proteins Using a Nude Mouse Model: 14-3-3 Zeta as a Candidate BiomarkerJ. Proteome Res., 2010,   6180–6190IF5.12,囊液样本)