細菌基因組完成圖真菌基因組完成圖微生物群落多樣性宏基因組測序服務全長轉錄組測序第三代測序服務非靶向代謝組學靶向代謝組學脂質組學離子組學脂肪酸檢測氨基酸檢測代謝組學服務定量蛋白質組服務雙向電泳服務修飾蛋白質組蛋白質芯片蛋白質譜鑒定蛋白互作檢測Western Blot蛋白質組學服務高通量測序數據分析蛋白質組學數據分析代謝組學數據分析芯片數據分析GO/Pathway富集分析相關性和聚類分析共表達網絡圖靶基因預測調控網絡圖蛋白相互作用網絡圖生物信息學服務CRISPR/Cas9載體構建穩定細胞系構建服務模式生物制備服務CRISPR/Cas9技術服務甲基化測序服務甲基化芯片服務甲基化驗證服務DNA甲基化服務lncRNA測序服務lncRNA芯片服務lncRNA定量PCR驗證lncRNA過表達服務lncRNA抑制服務lncRNA技術服務miRNA測序服務miRNA芯片服務miRNA定量PCR驗證miRNA過表達服務miRNA抑制服務miRNA靶基因驗證服務miRNA技術服務環狀RNA測序服務環狀RNA芯片服務環狀RNA定量PCR驗證環狀RNA過表達服務環狀RNA抑制服務環狀RNA技術服務轉錄組測序服務表達譜測序服務mRNA/lncRNA/環狀RNA 三合一芯片表達譜芯片服務熒光定量PCR驗證mRNA過表達服務mRNA抑制服務mRNA技術服務轉錄因子篩選服務抗體制備服務ChiP-Seq測序服務ChiP-qPCR技術服務EMSA技術服務luciferase 實驗服務轉錄因子技術服務mRNA定量PCR檢測miRNA定量PCR檢測lncRNA定量PCR檢測環狀RNA定量PCR檢測DNA拷貝數檢測相對定量PCR服務絕對定量PCR服務熒光定量PCR服務整體課題服務SNP分型檢測服務SSR/STR技術服務病毒包裝服務CRISPR/Cas9技術試劑miRNA功能研究試劑lncRNA功能研究試劑環狀RNA功能研究試劑mRNA功能研究試劑發表文獻樣品準備服務流程基金申請
非靶向代謝組學服務
服務詳情

   簡介

  非靶向代謝組學(即發現代謝組學)主要是將對照組和實驗組的代謝組(某一生物體的全部代謝物)進行比對,以找出其代謝物的差異。其分析一般包括:

    1、代謝譜分析(也稱為差異表達分析):在一組實驗和對照樣品中,尋找豐度改變有統計學意義的感興趣代謝物。

    2、鑒定:進行代謝譜分析后,鑒定這些代謝物的名稱或化學結構。

    3、解釋:研究流程的最后一步,解釋所發現的代謝物與生物過程或生物狀態之間的關聯。

    實驗流程



    數據分析


    非靶向代謝組學常用LC/MS、GC/MS、NMR三種檢測手段,優缺點如下表。

     檢測手段
    LC/MS
    靈敏度較高,無需衍生化,適合極性較大物質
    分離率不高,時間較長,具有偏向性
    GC/MS
    較好的分離效率和檢測靈敏度、適合極性較小物質
    衍生化限制了應用范圍,具有偏向性
    NMR
    精度高、對樣品限制少、不破壞樣品
    靈敏度較低、動態范圍有限


    技術優勢

    1、擁有標準化的實驗室操作規范和先進的儀器平臺,實驗周期短,質量可靠。

    2、擁有Waters XEVO GS-2 Q-TOFUPLC)液質聯用儀、Agilent 7890A-5975C氣質聯用儀和AVANCE III 600 MHz NMR等多種非靶向儀器平臺。

    3、多個商業數據庫、引入保留指數、超過百個的標準品庫,使GC-MS定性能力更強。

    4、擁有專業的生物信息團隊和大型硬件,可以為客戶提供個性化的生物信息分析服務。

    結果展示

    1、各樣品檢測出的代謝物的聚類分析圖

    2、樣品主成分分析(PCA



    3、PLSDA分析圖


    4、實驗組和對照組的差異代謝物列表


    5、差異代謝物biomarkerROC曲線分析

    6、差異代謝物的常規代謝通路分析(紅色點表示檢測到的差異代謝物)

    7、繪制代謝網絡圖(紅色為上調的代謝物,藍色為下調的代謝物)

    樣品要求

    1、植物樣本最少200mg,血液樣品至少1ml(血漿注意用肝素鈉防凝),血清0.5ml,尿液2ml,動物組織樣品至少1g,細胞樣品為1×107個細胞,酵母、微生物等干重200mg。

    2、樣品保存與運輸:在液氮或-80°C保存。干冰運輸。

    3、生物學重復次數一般來說,植物、細胞、微生物等至少6個生物學重復,動物樣本,由于其個體化差異較大,包括組織、血、尿液等至少10個生物學重復。臨床樣本,個體差異更大,血漿、尿液等至少要在30個生物學重復左右,無上限。具體根據文章發表檔次和實驗設計而定。

    參考文獻

    [1]    Hahm ER, Lee J, et al. Metabolic alterations in mammary cancer prevention by withaferin A in a clinically relevant mouse model. J Natl Cancer Inst. 2013; 105(15): 1111-22.

    [2]    N?rskov NP, Hedemann MS, et al. Multicompartmental nontargeted LC-MS metabolomics: explorative study on the metabolic responses of rye fiber versus refined wheat fiber intake in plasma and urine of hypercholesterolemic pigs. JProteome Res. 2013; 12(6): 2818-32.

    [3]    Huang Q, Tan Y, et al. Metabolic characterization of hepatocellular carcinoma using nontargeted tissue metabolomics. Cancer Res. 2013; 73(16): 4992-5002.