细菌基因组完成图真菌基因组完成图微生物群落多样性宏基因组测序服务全长转录组测序第三代测序服务非靶向代谢组学靶向代谢组学脂质组学离子组学脂肪酸检测氨基酸检测代谢组学服务定量蛋白质组服务双向电泳服务修饰蛋白质组蛋白质芯片蛋白质谱鉴定蛋白互作检测Western Blot蛋白质组学服务高通量测序数据分析蛋白质组学数据分析代谢组学数据分析芯片数据分析GO/Pathway富集分析相关性和聚类分析共表达网络图靶基因预测调控网络图蛋白相互作用网络图生物信息学服务CRISPR/Cas9载体构建稳定细胞系构建服务模式生物制备服务CRISPR/Cas9技术服务甲基化测序服务甲基化芯片服务甲基化验证服务DNA甲基化服务lncRNA测序服务lncRNA芯片服务lncRNA定量PCR验证lncRNA过表达服务lncRNA抑制服务lncRNA技术服务miRNA测序服务miRNA芯片服务miRNA定量PCR验证miRNA过表达服务miRNA抑制服务miRNA靶基因验证服务miRNA技术服务环状RNA测序服务环状RNA芯片服务环状RNA定量PCR验证环状RNA过表达服务环状RNA抑制服务环状RNA技术服务转录组测序服务表达谱测序服务mRNA/lncRNA/环状RNA 三合一芯片表达谱芯片服务荧光定量PCR验证mRNA过表达服务mRNA抑制服务mRNA技术服务转录因子筛选服务抗体制备服务ChiP-Seq测序服务ChiP-qPCR技术服务EMSA技术服务luciferase 实验服务转录因子技术服务mRNA定量PCR检测miRNA定量PCR检测lncRNA定量PCR检测环状RNA定量PCR检测DNA拷贝数检测相对定量PCR服务绝对定量PCR服务荧光定量PCR服务整体课题服务SNP分型检测服务SSR/STR技术服务病毒包装服务CRISPR/Cas9技术试剂miRNA功能研究试剂lncRNA功能研究试剂环状RNA功能研究试剂mRNA功能研究试剂发表文献样品准备服务流程基金申请
非靶向代谢组学服务
服务详情

   简介

  非靶向代谢组学(即发现代谢组学)主要是将对照组和实验组的代谢组(某一生物体的全部代谢物)进行比对,以找出其代谢物的差异。其分析一般包括:

    1、代谢谱分析(也称为差异表达分析):在一组实验和对照样品中,寻找丰度改变有统计学意义的感兴趣代谢物。

    2、鉴定:进行代谢谱分析后,鉴定这些代谢物的名称或化学结构。

    3、解释:研究流程的最后一步,解释所发现的代谢物与生物过程或生物状态之间的关联。

    实验流程



    数据分析


    非靶向代谢组学常用LC/MS、GC/MS、NMR三种检测手段,优缺点如下表。

     检测手段
    LC/MS
    灵敏度较高,无需衍生化,适合极性较大物质
    分离率不高,时间较长,具有偏向性
    GC/MS
    较好的分离效率和检测灵敏度、适合极性较小物质
    衍生化限制了应用范围,具有偏向性
    NMR
    精度高、对样品限制少、不破坏样品
    灵敏度较低、动态范围有限


    技术优势

    1、拥有标准化的实验室操作规范和先进的仪器平台,实验周期短,质量可靠。

    2、拥有Waters XEVO GS-2 Q-TOFUPLC)液质联用仪、Agilent 7890A-5975C气质联用仪和AVANCE III 600 MHz NMR等多种非靶向仪器平台。

    3、多个商业数据库、引入保留指数、超过百个的标准品库,使GC-MS定性能力更强。

    4、拥有专业的生物信息团队和大型硬件,可以为客户提供个性化的生物信息分析服务。

    结果展示

    1、各样品检测出的代谢物的聚类分析图

    2、样品主成分分析(PCA



    3、PLSDA分析图


    4、实验组和对照组的差异代谢物列表


    5、差异代谢物biomarkerROC曲线分析

    6、差异代谢物的常规代谢通路分析(红色点表示检测到的差异代谢物)

    7、绘制代谢网络图(红色为上调的代谢物,蓝色为下调的代谢物)

    样品要求

    1、植物样本最少200mg,血液样品至少1ml(血浆注意用肝素钠防凝),血清0.5ml,尿液2ml,动物组织样品至少1g,细胞样品为1×107个细胞,酵母、微生物等干重200mg。

    2、样品保存与运输:在液氮或-80°C保存。干冰运输。

    3、生物学重复次数一般来说,植物、细胞、微生物等至少6个生物学重复,动物样本,由于其个体化差异较大,包括组织、血、尿液等至少10个生物学重复。临床样本,个体差异更大,血浆、尿液等至少要在30个生物学重复左右,无上限。具体根据文章发表档次和实验设计而定。

    参考文献

    [1]    Hahm ER, Lee J, et al. Metabolic alterations in mammary cancer prevention by withaferin A in a clinically relevant mouse model. J Natl Cancer Inst. 2013; 105(15): 1111-22.

    [2]    N?rskov NP, Hedemann MS, et al. Multicompartmental nontargeted LC-MS metabolomics: explorative study on the metabolic responses of rye fiber versus refined wheat fiber intake in plasma and urine of hypercholesterolemic pigs. JProteome Res. 2013; 12(6): 2818-32.

    [3]    Huang Q, Tan Y, et al. Metabolic characterization of hepatocellular carcinoma using nontargeted tissue metabolomics. Cancer Res. 2013; 73(16): 4992-5002.