細菌基因組完成圖真菌基因組完成圖微生物群落多樣性宏基因組測序服務全長轉錄組測序第三代測序服務非靶向代謝組學靶向代謝組學脂質組學離子組學脂肪酸檢測氨基酸檢測代謝組學服務定量蛋白質組服務雙向電泳服務修飾蛋白質組蛋白質芯片蛋白質譜鑒定蛋白互作檢測Western Blot蛋白質組學服務高通量測序數據分析蛋白質組學數據分析代謝組學數據分析芯片數據分析GO/Pathway富集分析相關性和聚類分析共表達網絡圖靶基因預測調控網絡圖蛋白相互作用網絡圖生物信息學服務CRISPR/Cas9載體構建穩定細胞系構建服務模式生物制備服務CRISPR/Cas9技術服務甲基化測序服務甲基化芯片服務甲基化驗證服務DNA甲基化服務lncRNA測序服務lncRNA芯片服務lncRNA定量PCR驗證lncRNA過表達服務lncRNA抑制服務lncRNA技術服務miRNA測序服務miRNA芯片服務miRNA定量PCR驗證miRNA過表達服務miRNA抑制服務miRNA靶基因驗證服務miRNA技術服務環狀RNA測序服務環狀RNA芯片服務環狀RNA定量PCR驗證環狀RNA過表達服務環狀RNA抑制服務環狀RNA技術服務轉錄組測序服務表達譜測序服務mRNA/lncRNA/環狀RNA 三合一芯片表達譜芯片服務熒光定量PCR驗證mRNA過表達服務mRNA抑制服務mRNA技術服務轉錄因子篩選服務抗體制備服務ChiP-Seq測序服務ChiP-qPCR技術服務EMSA技術服務luciferase 實驗服務轉錄因子技術服務mRNA定量PCR檢測miRNA定量PCR檢測lncRNA定量PCR檢測環狀RNA定量PCR檢測DNA拷貝數檢測相對定量PCR服務絕對定量PCR服務熒光定量PCR服務整體課題服務SNP分型檢測服務SSR/STR技術服務病毒包裝服務CRISPR/Cas9技術試劑miRNA功能研究試劑lncRNA功能研究試劑環狀RNA功能研究試劑mRNA功能研究試劑發表文獻樣品準備服務流程基金申請
宏基因組測序服務
服務詳情

簡介

  微生物種類繁多,培養條件復雜。據統計現今只有1%的微生物可以在實驗室進行純種培養。宏基因組學是將環境樣品中的微生物群落作為整體進行研究的學科。與其他研究環境群落的方法相比,宏基因組測序具有通量大、產出數據多、更為高效的優勢。采用宏基因組測序的方法對微生物群落進行研究,不僅能夠獲得樣本微生物物種的組成和豐度信息,還可以進行功能基因注釋,獲取樣品間基因差異信息。

  宏基因測序是指對環境樣品中所有微生物基因組DNA片段化后進行高通量測序,進行序列組裝和基因注釋,獲得部分不可純培養微生物的基因組序列,分析該環境下所有微生物基因集信息。  

  通過宏基因組測序,能夠解釋微生物群落多樣性、種群結構、進化關系、功能活性及環境之間的相互協作關系,極大地擴展了微生物學研究范疇。

生物信息分析

1. 原始數據整理、過濾及質量評估

2. 基于物種豐度分析:    ?物種豐度列表    ?稀釋曲線

3. 基于物種豐度分析:    ?豐度分布曲線圖    ?生物多樣性指數(α多樣性)列表    ?物種豐度差異性分析列表    ?多樣品物種分布柱圖    ?豐度差異物種聚類分析    ?PCA圖    ?Krona圖

4. 基因豐度列表:    ?提取基因分級注釋豐度列表(KO、NOG、subsystem)    ?功能基因列表    ?生成venn圖    ?基因豐度差異性分析列表    ?豐度差異基因聚類分析    ?富集分析(KO)

5. 根據客戶需求進行個性化分析

結果展示

1、樣品稀釋曲線


2、不同樣品微生物群落結構差異


3、實驗組和對照組豐度差異基因的GO功能分析


4、實驗組和對照組豐度差異基因的Pathway分析


5、 全基因組拼接環狀圖

樣品要求

1、樣品采集:樣品采集條件的一致是最為重要的環節,嚴格按照采樣標準采樣,采樣后立即封存樣品冷凍保存。

2、樣品DNA:環境因素異常復雜,許多物質或抑制因子影響后續PCR、測序文庫構建和序列測定,常規提取方法不一定適合,建議采用專用試劑盒提取。PE文庫DNA濃度≥20 ng/μl,總量≥6 μg(熒光定量),并確保電泳檢測無明顯RNA條帶,基因組條帶清晰、完整;基因組DNA完全無降解;提供DNA電泳檢測照片,用自封袋密封后隨樣品一起送樣;組織樣品﹥1.5 g。

3、樣品保存期間切忌反復凍融。

4、送樣管務必標清樣品編號,管口使用Parafilm膜密封。